讲座时间

2025年7月29日 14:00-17:00

讲座地点

金凤实验室1号楼809会议室

讲座题目：SuperSCC:single cell hierarchical clustering reveals cross-tissue conserved gene modules

主讲人简介

唐峰，广州国家实验室博士后，合作导师田鲁亦研究员。博士毕业于澳大利亚阿德莱德大学生物医学专业，专注于单细胞RNA测序与空间转录组学的数据分析与算法开发。主要从事创新算法设计与生物医学应用，致力于揭示复杂疾病的分子机制，为疾病机制解析和精准医学提供技术支持。目前以第一作者发表SCI论文5篇。

讲座简介

单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析面临批次效应干扰、细胞身份层级解析困难、跨数据集保守基因模块识别复杂等挑战。同时，传统分析流程常忽视病理状态下细胞状态的动态变化，难以揭示疾病演进中的关键细胞程序。为了解决上述挑战，我们开发了新型单细胞数据分析框架SuperSCC。SuperSCC通过整合监督特征选择、图聚类和层级合并策略，无需数据整合即可精准识别细胞类型与状态，并实现跨队列基因模块的发现，为复杂组织细胞图谱的构建提供了新思路。本报告基于课题组新开发的SuperSCC算法，以肺癌和免疫微环境等病理场景为研究背景，展示其在跨组织保守基因模块挖掘、稀有细胞状态鉴定及免疫治疗响应预测中的应用成果，为疾病研究和精准医学提供更具生物学意义的分析工具。

讲座题目：Advancing sequencing-based spatial transcriptomics with a comprehensive benchmarking study

主讲人简介

尤月，广州国家实验室博士后，合作导师田鲁亦研究员。博士毕业于澳大利亚墨尔本大学生物科学专业，研究方向为单细胞多组学算法开发及空间组学数据解析。主持国家自然科学基金博士后特别资助（站中）及面上项目各1项。以第一作者或通讯作者在 Nature Methods、Signal Transduction and Targeted Therapy、Genome Biology 等国际顶刊发表论文多篇。

讲座简介

空间转录组学正在重塑生命科学研究的时空维度，但技术平台间分辨率、捕获效率和扩散差异巨大，缺乏统一基准成为方法选型和算法开发的“卡脖子”环节。尤月博士以首篇发表于 Nature Methods 的系统性研究为切入点，构建了涵盖小鼠大脑、肾脏、小肠等具有清晰组织学架构的参考组织库，并在 35 组实验中横向评测 11 种主流 sST 技术，首次将“分子扩散”量化为影响有效分辨率的核心变量；在此基础上，配套开发了可重现的切片与渗透优化协议及开放数据库 genographix.com，实现从实验设计、参数标定到计算评估的全流程标准化，为低丰度稀有细胞状态的精准识别、跨平台数据整合以及后续空间多组学技术迭代提供了“黄金标准”与一站式工具。

欢迎大家积极参加